In Gotham City und Metropolis gibt es verschiedene Stadtzonen und in so ziemlich jeder gibt es für Helden und Schurken zu tun.
In Metropolis gibt es drei Polizeireviere/Nactclubs mit einem Teleporter zum Wachturm oder zur Halle des Schreckens. In Gotham City gibt es nur zwei Unterschlupfe, aber es gibt dennoch insgesamt drei Teleporter zur Halle bzw. zum Wachturm. Die Unterschlupfe sind in verschiedenen Stadtteilen.
Stadtzonen in Metropolis:[]
*Chinatown(Unterschlupf)[]
*Stadtmitte(Unterschlupf)[]
*Little Bohemia(Unterschlupf)[]
*Altstadt[]
*Tomorrow District[]
Das Stahlwerk und der Pier nehmen nicht allzu weit weg von Chinatown auch einen kleinen Teil von Metropolis ein. Außerdem befindet sich auch Stryker's Island in der Nähe von Chinatown.
Der Cetennial Park mit der Superman-Statue ist auf jeden Fall auch von Bedeutung.
Stadtzonen in Gotham City:[]
*Burnley(Unterschlupf der Schurken)[]
*North Burnley(Unterschlupf der Schurken)[]
*South Gotham(Teleporter zum Wachturm/zur Halle des Schreckens)[]
*East End(Unterschlupf der Helden)[]
*Diamond District(Unterschlupf der Helden)[]
*Amüsiermeile[]
Der Robinson Park und einige andere Orte sind ebefalls wichtig in Gotham City. Arkham Asylum birgt ebenso wie Ace Chemicals seine Gefahren.
Central City[]
Diese Stadt ist nicht in Stadtzonen aufgeteilt, weil es nicht genug Fläche dafür bietet. Ihr könnt diese Stadt auch nur dann erreichen, wenn ihr das DLC "Lightning Strikes" besitzt und eine Kampfwertung von mindestens 53 habt.